AMAÇ

Bu eğitimin amacı, katılımcılara mikrobiyom araştırmalarında kullanılan güncel teorik yaklaşımları ve uygulamalı biyoinformatik analiz adımlarını bütüncül bir çerçevede kazandırmaktır. Üç gün sürecek program kapsamında, yeni nesil dizileme (NGS) verilerinin kalite kontrolünden başlayarak 16S rRNA temelli taksonomik analizler, çeşitlilik ölçümleri ve karşılaştırmalı istatistiksel değerlendirmeler uygulamalı olarak öğretilecek; ayrıca metagenomik ve entegre multi-omik yaklaşımların mikrobiyom çalışmalarındaki yeri ve translasyonel potansiyeli ele alınacaktır. Katılımcıların gerçek veri setleri üzerinde küçük gruplar halinde çalışarak analiz süreçlerini uçtan uca deneyimlemeleri, sonuçları biyolojik bağlamda yorumlamaları ve proje sunumu formatında aktarmaları hedeflenmektedir.

KAPSAM

Bu etkinlik, mikrobiyom araştırmalarında temel kavramsal çerçeveden ileri düzey veri entegrasyonuna kadar uzanan kapsamlı bir içerik sunmaktadır. Program; mikrobiyal ekosistemlerin yapısı ve dinamiklerinin anlaşılması, çevresel ve konak-ilişkili mikrobiyom çalışmalarındaki güncel yaklaşımlar, yeni nesil dizileme verilerinde kalite kontrol ve ön işleme adımları ile 16S rRNA temelli taksonomik ve çeşitlilik analizlerini kapsamaktadır. Bunun yanı sıra metagenomik analizlere giriş, sistem biyolojisi perspektifi ve multi-omik veri entegrasyonu gibi ileri düzey konular ele alınarak mikrobiyom verilerinin biyolojik ve translasyonel bağlamda yorumlanması hedeflenmektedir. Teorik dersler, uygulamalı bilgisayar oturumları ve grup temelli proje çalışmaları ile desteklenen etkinlik, katılımcıların farklı ekosistemlere ait gerçek veri setleri üzerinde analiz yapmalarını ve sonuçlarını bilimsel sunum formatında paylaşmalarını içermektedir.